Организации на упрощённой системе налогообложения не могут одновременно применять разные ставки налога на добавленную стоимость. Такое разъяснение дал Министерство финансов РФ.Компании на УСН, которые освобождены от уплаты НДС, вправе по собственной инициативе выставлять счета-фактуры с НДС по ставке 22%. В этом случае налог подлежит уплате в бюджет, однако право на налоговый вычет не возникает. Законодательство не запрещает такую практику, если она осуществляется по просьбе контрагентов.
Однако правила меняются при превышении лимита доходов, дающего право на освобождение от НДС. В 2026 году этот порог составляет 20 млн рублей. После утраты льготы организация обязана выбрать режим налогообложения НДС.
Если компания переходит на применение пониженной ставки НДС 5%, она должна использовать её во всех операциях и для всех покупателей без исключений. Выставление счетов-фактур с иной ставкой, в том числе 22%, становится недопустимым, даже если ранее такие документы оформлялись по просьбе клиентов.
Таким образом, после выбора ставки НДС 5% продавец обязан отказать покупателям в выставлении счетов-фактур с другой ставкой налога. Соответствующие выводы содержатся в письме Минфина от 19 января 2025 года № 03-07-11/111725.


